Lượt về chung kết Cúp Intertoto 2006 đã chứng kiến bất ngờ khi chuyên gia đoạt cúp Intertoto, Villarreal thất thủ cay đắng trên đất Slovenia. Trong khi đó Newcastle dễ dàng giành chiến thắng trước Lillestrom (Na Uy) với tỷ số 3-0 để giành vé thi đấu tại cúp UEFA.

Các cầu thủ Newcastle ăn mừng chiến thắng khi giành vé dự UEFA năm nay.

Bất ngờ để thua trên sân nhà với tỷ số 1-2 trước NK Maribor, Villarreal đã tự làm khó mình khi phải đến làm khách trên đất Slovenia. Được đánh giá cao hơn NK Maribor nhưng "tàu ngầm vàng" Villarreal không thể hiện được đẳng cấp của mình. Buộc phải giành chiến thắng mới mong lật ngược tình thế, các cầu thủ Villarreal đã quá nôn nóng tấn công. Tuy nhiên, ở trận đấu này các cầu thủ NK Maribor chơi rất tỉnh táo và hoá giải tất cả những đợt tấn công của đội khách.

Bàn mở tỷ số ở phút 85 của Nihat Kahveci đã mang lại hy vọng cho Villarreal nhưng Gorazad đã kịp quân bình tỷ số ở phút cuối cùng của trận đấu. Bị cầm hoà với tỷ số 1-1, "tàu ngầm vàng" đành chấp nhận thất bại trước "đàn em" NK Maribor trong một thế trận phòng thủ quá vững chắc của chủ nhà.

ở trận đấu khác tại Na Uy, đại diện bóng đá Anh Newcastle đã có chiến thắng dễ dàng trước chủ nhà Lillestrom với tỷ số 3-0. Tiền đạo Ameobi đã trở thành người hùng của Newcastel khi ghi bàn thắng ở phút 29 và 36 trước khi Emre ấn định chiến thắng 3-0 ở phút chót. Với kết quả trên, Newcastle đã giành chiến thắng chung cuộc 4-1 và chính thức giành vé dự cúp UEFA mùa giải năm nay.

Kết quả các trận đấu khác:
Marseille - Dnipro: 2-2
Hertha Berlin - FC Moskva: 2-0
Auxerre - Farul Constanta: 4-2